La Orden 66 fue la orden que el Canciller Palpatine le dio al Gran Ejército de la República en el Episodio III: La Venganza de los Sith. Fue una de las varias órdenes de contingencia dadas a los Clone Troopers, que fueron entrenados para seguir sin dudas en caso de emergencia. La Orden 66, que solo podía ejecutarse por orden directa de Palpatine, pedía a los Clone Troopers que mataran a sus líderes Jedi. Aparentemente en su lugar para evitar que los Jedi se volvieran contra la República, la Orden 66 era realmente el plan de Palpatine para eliminar la Orden Jedi para que los Sith pudieran tomar el poder.
En el universo: la Orden 66 establece:
En el caso de que los oficiales Jedi actúen en contra de los intereses de la República, y después de recibir órdenes específicas verificadas como provenientes directamente del Comandante Supremo (Canciller), los comandantes de GAR eliminarán a esos oficiales por la fuerza letal, y el comando de GAR volverá al Comandante Supremo (Canciller) hasta que se establezca una nueva estructura de comando.
Cuando se emitió la Orden 66, varios Clone Troopers creyeron que era una orden falsa y comenzaron a proteger a los Jedi en lugar de matarlos. Varios otros Jedi sobrevivieron matando a los Soldados Clon atacantes.
Darth Vader dirigió la campaña para cazar y matar a la mayoría de los sobrevivientes en los años posteriores a la Orden 66. Esta destrucción imperial de los Jedi se conoce como la Gran Purga Jedi. Más de 100 Jedi y ex Jedi se escondieron y sobrevivieron a toda la Purga; Por ejemplo, Yoda y Obi-Wan Kenobi sobrevivieron al exiliarse en los planetas remotos de Dagobah y Tatooine.
